Get Adobe Flash player

Свежие записи

Свежие комментарии

    Сфера применения подобных технологий

    Вы можете быстро и просто только у нас забронировать авиабилеты киев по не дорогим ценам. .

    Сфера применения подобных технологий

    Сфера применения подобных технологий исключительно широ­ка. В частности, данный методический арсенал уже позволил раз­работать новые принципы классификации злокачественных ново­образований и установить ранее неизвестные прогностические груп­пы опухолей человека. Однако потенциальный круг проблем, в решении которых microarrays могут оказать неоценимую помощь, далеко не исчерпывается онкологией. Несомненно, может быть по­лучена важная новая информация, касающаяся влияния лекарств и факторов окружающей среды на спектр экспрессируемых генов.

    Несмотря на то, что технологии microarrays разработаны срав­нительно недавно, они становятся незаменимым орудием познания сложнейшего процесса регуляции генной активности как в норме, так и при самых разнообразных патологических состояниях.

     

    Остановимся подробнее на механизмах

    Остановимся подробнее на механизмах

    Остановимся подробнее на механизмах, согласно которым вы­сокая предрасположенность к определённым типам опухолей зача­стую передаётся от родителям к потомству. Причина заключается в существовании так называемых рецессивных онкогенов. Если в со­матической клетке повреждён лишь один аллель подобного гена, то клетка остаётся фенотипически нормальной. Однако если мутиро- ваны и материнская, и отцовская копии, то клетка приобретает не­которые черты злокачественной трансформации. Теперь предста­вим, что мутация одного из аллелей рецессивного онкогена переда­на пациенту через гаметы. Тогда все его соматические клетки будут иметь лишь одну «здоровую» копию. Достаточно повреждения ос­тавшегося интактного аллеля лишь в одной из миллионов клеток органа-мишени, и возникнет клон с потенциями к злокачественно­му росту (рис. 9). Существенно, что если на уровне клетки подоб­ные нарушения носят рецессивный характер — опасно лишь по­вреждение обоих аллелей, то на уровне организмов наследование происходит по доминантному типу. Носительство зародышевых раковых мутаций бывает лишь гетерозиготным — по-видимому, ана­логичные гомозиготные состояния несовместимы с нормальным развитием эмбриона [Имянитов Е.Н. и др., 1993; Knudson A.G. Jr., 1989; Caldas С., Ponder B.A.J., 1997; Quesnel S., Malkin D., 1997].

    Из подобной схемы вытекают основные клинико-генетические характеристики наследственных опухолевых синдромов: 1) доми­нантный тип наследования (гетерозиготы, т. е. лица с врождённым поражением лишь одного из двух аллелей антионкогена, являются «больными»); 2) исключительно высокая встречаемость онкологи­ческой патологии среди кровных родственников больного (это ред­кий пример заболевания, при котором доминантность признака сочетается с высокими шансами дожить до детородного возраста, а также нормальной фертильностью; следовательно, риск новообра­зования легко передаётся из поколения в поколение); 3) необычно ранний возраст появления неоплазм (достаточно мутации всего в од­ном аллеле антионкогена, а не в двух, поэтому полная функциональ­ная инактивация последнего у носителей случается намного быст­рее, чем у здоровых); 4) множественность опухолей (больше шан­сов, что блокировка супрессорного гена произойдёт в двух независимых клеточных клонах) [Caldas С., Ponder B.A.J., 1997; Quesnel S., Malkin D., 1997].

    Периферические Т-клеточные лимфомы

    Периферические Т-клеточные лимфомы

    Периферические Т-клеточные лимфомы включают несколько раз­личных опухолей, отличающихся по их естественной истории от В-кле- точных лимфом. Наиболее распространенной среди всех HJI является крупноклеточная В-лимфома (33%), далее следует В-клеточная фолли­кулярная лимфома (22%), остальные типы опухолей встречаются с час­тотой менее 10% [A clinical evaluation of the International Lymphoma Study Group classification of non-Hodgkin's lymphoma. The Non-Hodgkin's Lymphoma Classification Project, 1997]. Для точной классификации лим­фом и установления диагноза необходимо применять комплексный ал­горитм, включающий морфологическое исследование, анализ экспрес­сии генов и определение фракции пролиферирующих клеток [Harris et al., 2001].

    Стадирование HJT также осуществляется согласно выработан­ной системе, которая была принята в 1971 г. [Carbone et al., 1971]. Основной идеей данной классификации служит четкое дифферен­цирование локализованного (стадии 1 и 2) и диссеминированного роста опухолей (стадии 3 и 4). Однако применяющиеся принципы классификации не учитывают некоторых существенных факторов, в частности таких, как вовлеченность костного мозга и ЦНС.

    Прогностические факторы HJI изучались в ходе специального международного проекта, в результате которого был выработан меж­дународный прогностический индекс [A predictive model for aggressive non-Hodgkin's lymphoma. The International Non-Hodgkin's Lymphoma Prognostic Factors Project. 1993]. Плохой прогноз ассоциирован с такими показателями, как возраст пациента старше 60 лет, плохое общее состояние, диссеминация процесса, размер опухоли более 10 см, вовлечение костного мозга, определённые морфологические особенности опухоли и т. д. Несомненно, в будущем можно ожидать появления новых биологических прогностических факторов, осно­ванных прежде всего на совершенствовании подходов к изучению «экспрессионных» портретов опухолей [Shipp et al., 2002].

    ДНК-диагностика в профилактике и ранней диагностике опухолей

    ДНК-диагностика в профилактике и ранней диагностике опухолей

    Залогом успешного лечения новообразований является их своевре­менная диагностика. Существующие методы клинического скринин­га обладают вполне достаточной эффективностью; однако по целому ряду причин их регулярное использование в полном масштабе (т. е. на всей человеческой популяции) представляется весьма затруднитель­ным. Концентрация диагностических мероприятий на так называе­мых группах онкологического риска признаётся разумным компро­миссом, обеспечивающим сфокусированность превентивных усилий именно на тех индивидуумах, которые в них больше всего нуждаются. Поэтому разработка научно-обоснованных подходов к формированию подобных групп представляется исключительно важной задачей.

    Классическим примером онкологической предрасположеннос­ти является контакт с вредными факторами окружающей среды (курение, неправильное питание, производственные вредности и т. д.) [Худолей, 1999]. Молекулярно-генетические исследования позво­лили выделить ещё как минимум три «новых» категории факторов риска: хроническое носительство онкоспецифических вирусов, присутствие наследственных «раковых» мутаций и неблагоприят­ное сочетание аллелей некоторых полиморфных генов.

    Перспективные разработки

    Перспективные разработки

    За последние годы появились перспективные разработки в об­ласти высокочувствительной детекции белков, поэтому исследова­ния молекулярных маркеров рака в настоящее время включают не только геномные, но и протеомные подходы. Тем не менее существу­ющие методики пока не удовлетворяют требованиям современной медицины вследствие неприемлемо высокой частоты ложно-поло­жительных и ложноотрицательных результатов. Таким образом «маркерная» диагностика злокачественных процессов пока отно­сится лишь к области перспектив и в своём настоящем виде не мо­жет служить в качестве самостоятельного метода детекции новооб­разований [Sidransky, 2002].

    КДНК-эррейз

    КДНК-эррейз

    Метод «кДНК-эррейз» основан на иммобилизации на подлож­ках множества коротких отрезков односпиральной ДНК, [Khrapko et al., 1989]. Как cDNA-arrays [Lockhart and Winzeler, 2000], так и серийный анализ экспрессии генов (SAGE) [Velculescu et al., 2000] способны одновременно определить экс­прессию большого числа генов в клеточной популяции, напри­мер, в конкретном образце опухоли. Тысячи образцов кДНК или олигонуклеотидов автоматически наносятся на твердую основу в упорядоченном виде, или же олигонуклеотиды синтезируются непосредственно на матрице [Lipshutz, Fodor, 1999]. Эти прикреп­ленные к матрице ДНК, соответствующие множеству генов, на­зывают пробами. С целью определения представительства генов из анализируемого образца ткани выделяют тотальную РНК и синтезируют кДНК в реакции обратной транскрипции. В ходе данной реакции кДНК метят с помощью флуоресцентного кра­сителя или радиоактивного изотопа и получают так называемые мишени (targets). Мишени затем гибридизуют с пробами на мик­рочипах. После детекции сигналов с помощью лазерного скане­ра профили экспрессии подвергают математическому анализу [Zhang et al., 2001].

    Генетические механизмы метастазирования

    Генетические механизмы метастазирования

    Способность к метастазированию является основным свойством афессивности РПЖ. Генетический контроль метастазирования осу­ществляется посредством усиленной экспрессии специфических генов, способствующих приобретению опухолью метастатическо­го фенотипа. Проведены масштабные исследования, направленные на выявление кандидатных генов, ответственных за прогрессию РПЖ. В частности, получены данные об ассоциации между экс­прессией некоторых генов и приобретением клетками метастатичес­кого фенотипа. Одним из таких примеров является ген F24, харак­теризующийся исключительно высоким уровнем экспрессии в клетках злокачественных линий РПЖ (PC-34D-195) и не эксп- рессирующийся в линии нормальных клеток (PNT-2) [Foster et al., 1999]. Наряду с этим, на хромосоме llpl 1.2 открыт ген небольшого размера КА11, обладающий специфической активностью в отно­шении метастазирования. Еще один ген, предположительно ассо­циированный с процессом метастазирования, был обнаружен на хромосоме 1 [Foster etal., 1999].

    Кроме сказанного, обращает внимание тот факт, что в клетках карциномы простаты обнаруживаются существенные изменения функциональной активности Na+ и К+-ионных каналов, что ока­зывает существенное влияние на поведение клеток. Следовательно, экспрессия белков ионных каналов представляет собой новый тип маркеров метастазирования РПЖ, а возможно, и других опухолей [Foster etal., 1999]. Не исключено, что ионные каналы, которые уже используются в качестве мишени при лечении некоторых заболе­ваний (инсульт, гипертония и др.), приобретут терапевтическое зна­чение и при РПЖ.

    Молекулярная генетика

    Молекулярная генетика

    Универсальной чертой герминогенных опухолей является увели­чение копийности генетического материала, расположенного на ко­ротком плече хромосомы 12. Это событие ассоциировано с увеличе­нием представленности продуктов целого ряда генов, расположен­ных на хромосоме 12р, однако до сих пор остаётся неясным, активация какого именно гена является центральным событием для канцерогенеза. Помимо этого, в опухолях I типа часто наблюдает­ся увеличение копийности lq и 20q, а также утрата хромосом 1р, 4 и 6q. Характерными нарушениями для новообразований второго типа являются увеличение копийности хромосом 7,8, 21 и X, в то время как утраты генетического материала затрагивают хромосомы 1 р, 11, 13 и 18. Сперматоцитные семиномы, в отличие от всех других гер­миногенных опухолей, не содержат повреждений хромосомы 12, а отличаются появлением экстра-копий хромосомы 9 [von Eyben, 2004; Oosterhuis, Looijenga, 2005].

    Ген-супрессор p53 в герминогенных опухолях мутирован редко (менее 10%), что объясняет их чувствительность к апоптозу, и, сле­довательно, к химиотерапевтическим воздействиям [Jones, Vasey, 2003].

    ДНК-диагностика в лечении и мониторинге онкологических пациентов

    ДНК-диагностика в лечении и мониторинге онкологических пациентов

    Исторически первым полигоном по внедрению молекулярно-ге- нетических подходов стала клиника лейкозов. В частности, молеку- лярно-цитогенетические и ПЦР-методы определения специфических транслокаций стали рутинно применяться уже в начале 90-х гг. XX века. Существенно, что разработанная за последние 15 лет класси­фикация так называемых характерных транслокаций стала «золотым стандартом» онкогематологии, и не только дополнила, но в опреде­лённой мере даже вытеснилатрадиционные, цитологические подхо­ды к уточненной диагностике лейкемий [Sen et al., 2002].

    Идеология молекулярного портрета солидных опухолей разрабо­тана несколько хуже, в связи с большей генетической гетерогенно­стью последних. Тем не менее некоторые ДНК-тесты уже включе­ны в состав повседневных диагностических процедур и имеют ни­чуть не меньшее значение, чем морфологическое исследование опухолевого материала. Например, статус онкогена NMYC (единич­ная копия или амплификация) учитывается при определении ста­дии заболевания у больных нейробластомой. Диагноз рака молоч­ной железы в современных клиниках сопровождается анализом активации гена ERBB2/HER2. Многие госпитали рутинно осуще­ствляют тест на микросателлитную нестабильность при классифи­цировании новообразований толстой кишки (Tsuchida et al., 1996; Хансон, Имянитов, 2002; Muller, Fishel, 2002].

    Сравнительный анализ профилей

    Сравнительный анализ профилей

    Сравнительный анализ профилей экспрессии генов в образцах, взятых из разных участков опухоли, открывает перспективы для более тонкого и углубленного понимания механизмов прогрессии злокачественных новообразований. Cole и соавт. (1999) на основании такого рода данных предложили трехмерную модель эк­спрессии генов в разных участках индивидуальной опухоли. Данная модель позволяет идентифицировать те ключевые гены, от экспрессии которых зависит переход от морфологически выявлен­ных предраковых изменений к истинно инвазивному росту опу­холи.

    Большой интерес представляют попытки описания так называ­емого молекулярного портрета опухолей отдельных локализаций и поиски его корреляций с клиническими параметрами злокачествен­ных новообразований. Например, на основании клинических и ги­стологических данных описаны два субтипа рака эндометрия (РЭ) [Deligdisch, Holinka, 1987]. Тип I РЭ относится гистологически к вы- сокодифференцированным эндометриоидам. Пациенты, страдаю­щие РЭ первого типа имеют относительно благоприятный прогноз. В противоположность этому, тип II РЭ относится гистологически к недифференцированным неэндометриоидным опухолям и характе­ризуется ранним метастазированием и агрессивным течением забо­левания.

    Опубликованы результаты cDNA arrays анализа указанных двух типов РЭ [Risinger et al., 2003]. Авторы работы исследовали профиль экспрессии в 19 эндометриоидных раках, 16 неэндометриоидных опухолях и 7 образцах нормального эндометрия. При этом обнару­жен 191 ген, экспрессия которого различается более чем двукратно между РЭ I и II типов. Кроме того, было установлено, что оба типа опухолей отличаются по характеру экспрессии генов от нормаль­ной ткани эндометрия.